Здравствуйте!
Задача такая: на высоких частотах АЦП(2 канала) подать однократный сигнал ЦАП, через некотрое время еще один(получается что-то вроде прямоугольного импульса). При этом все время ведется измерение АЦП.
Однако при частоте АЦП выше 1МГц наблюдается "уползание" значений АЦП. Т. е. должно быть , скажем, 10мВ, а наблюдается 6 и т.п. (Форма получаемых импульсов не меняется.)Причем чем больше частота тем сильнее это уползание. Доходит даже до отрицательных значений.
Помогите! С чем это может быть связано?

Двухканальный режим АЦП L-783 на частоте 1 МГц требует применения источников сигналов, имеющих  внутреннее сопротивление десятки Ом в полосе частот десятки МГц. В Вашем случае это обеспечивается?
А при настройке L-783 на одноканальном режим подобные искажения сигнала пропадают?

См., также статью: http://www.lcard.ru/distortions.pdf

в одноканальном режиме все пропадает.
а насчет источников сигналов надо еще подумать..

Какие источники сигналов используете? Какие длины проводов до них?