Были докуплены LTR-U-1-4 / LTR27. В них оказался другой порядок установки модулей. Можно ли самостоятельно переставить модуля? Не теряется ли при этом гарантия?

Ответ на Ваш вопрос см. в http://www.lcard.ru/download/ltr.pdf , п.3.6.2.2.

При заказе конфигураций с LTR27, LTR51, LTR-U-1-4, LTR-EU-2-5 всегда указывайте конфигурацию модулей и субмодулей, если для Вашей системы это важно.