Суть проблемы заключается в том, что по непонятной мне причине АЦП перестает корректно работать на низких напряжениях ( на пределе 10В, напряжения меньше 1В), выражается в том что отсчеты вообще не меняют своего значения и остаются на одном уровне, около 1В. Самое интересное происходит, если изменить коэф. усиления. Картина повторяется, причем например на коэф. усиления 4, АЦП по-прежнему может работать в диапазоне до 10В, но вот перестает работать уже начиная с 5В и ниже.
Ну, а вопрос собственно, в чем может быть причина?

Подобного рода странные поведения обычно связаны с неправильным подключением или с программными настройками, не соответствующими фактическому подключению. Сверьте правильность подключения с руководством, а также посмотрите примеры:
http://www.lcard.ru/download/e14-140_conn_examples.pdf

Спасибо, действительно GND32 не был подключен к земле.