Возможно ли в модуле E2010 задать сортировку измеренных данных по номеру канала, если я использую режим останова сбора данных через заданное кол-во кадров отсчётов? Другими словами, я хочу, чтобы при чтении данных с модуля сначала шел первый канал, потом второй и так далее.

В какой последовательности в управляющей таблице пропишите опрос номеров каналов, в такой последовательности и будут выливаться данные из E20-10. Разбор этих данных по разным массивам - это уже задача программы верхнего уровня. Но если Вам нужно, допустим, сначала оцифровать N отсчётов одного канала, потом М отсчётов от другого, то с новой прошивкой E20-10 размер управляющей таблицы может достигать 8K отсчётов, и в рамках этих 8K можно запрограммировать любую последовательность опроса каналов для кадра размером до 8K.