Возможно ли подключить модуль Е14-440 через микросхему  гальванической развязки USB интерфейса ADuM4160?
http://www.analog.com/en/interface/digi … oduct.html
Почувствует ли эту развязку существующее программное обеспечение?

Технически подключить возможно. Как подключить, потребуется ли коррекция ПО - эти вопросы требуют изучения и обязательной практической проверки. Пока в L-Card этой задачей не занимались...

2 Гарманов Александр - cмешно. Не потребует, миткросхема прозрачна для пакетов абсолютно

Что прозрачна-согласен, но там сигналы управления есть. Вы считаете, что без управления ими можно обойтись? Там pull-up, pull-down резисторами нужно управлять. Если у Вас есть соображения на этот счёт, поделитесь. Мы не пытались применять этот чип. В любом случае, без практической проверки точно не обойтись.