Существенны ли отличия в API E440 и Е20_10 ?

Андрей, по отличиям API, конечно, ответят.
Но отличия здесь обязаны быть, поскольку по архитектуре между этими изделиями гораздо больше различий, чем общего:
- Частота АЦП 0-400 кГц против 1-10 МГц (меньшие частоты получаются прореживанием данных в E20-10).
- АЦП с возможностью однократного запуска против конвейерного АЦП, рассчитанного на оцифровку потока.
- Различные поддиапазоны входных  напряжений АЦП.
- Коммутация до 16/32 каналов без входных буферов против коммутации до 4-х каналов с входными буферами (позволяет подключать длинные кабели и относительно высокоомные источники сигналов в многоканальном режиме).
- Архитектура на основе сигнального процессора  против архитектуры на основе ПЛИС и большого внутреннего буфера FIFO.
- Разные режимы синхронизации.

Общее:
- Разрядность АЦП 14 бит.
- Асинхронный ЦАП 2 канала 12 бит (опция)
- Асинхронные линии цифрового ввода-вывода 16-входных, 16-выходных.

По API так никто и не ответил

смотря что считать существенными отличиями... скачайте lcomp.exe и посмотрите пример L7XX.TST...

Хорошо, тогда задам вопрос по-другому.
Универсальный API lcomp.dll позволяет использовать полную функциональность Е20-10 ?

Да, позволяет. LGraph2 работает с модулями через lcomp.dll, все функции одинаковы для E440 и E20-10, кроме специфических для модуля полей структуры, через которую происходит конфигурирование модуля.