Как развязать входы модуля E14-440, датчики подключаемые к модулю – это термопара (ХА) – индукционный датчик и холловский элемент.

Как я понимаю нужна поканальная гальваноразвязка между этими каналами.
Проще всего воспользоваться готовыми решениями, например от DataForce. очень хорошее, но не самое дешевое решение.
Может проще и дешевле применить субмодули Н27, дешевле, если хватит 100 Гц.

100 Гц маловато ... а стоимость DataForce?

Действительно что галванически развязать аналоговый сигнал практически невозможно? Либо давольно дорого...и вообще как вы считаете - лабораторные стенды требуют применения подобных мер?