Приветствую.

В чем может быть причина разных амплитуд выходных сигналов на этих модулях, точнее амплитуда сигнала с канала LTR22 ниже по модулю на 0.02V? И как можно убрать такое поведение?

LTR22: функция GetCalibrovka выполнена, ADCRange = 10V, частота 3472Гц, в функцию LTR22_ProcessData параметры CalibrMainPSet и CalibrExtraVolts переданы как true.

LTR24: _ltr24api.AdcRange.Range_10, частота Freq_3K6, в функцию LTR24_ProcessData переданы флаги ltr24api.ProcFlags.Volt | ltr24api.ProcFlags.Calibr | ltr24api.ProcFlags.AfcCor.

ниже по модулю на 0.02V. не совсем корректно написал. вернее при максимальной амплитуде сигнала на LTR24 0.05V, на LTR22 максимальная амплитуда сигнала 0.03V

а GetConfig для ltr24 вызывался?

Да.
Вызывается LTR24_GetConfig, потом установка частоты, настройка каналов и после всего этого LTR24_SetADC.

Схема с подключенным датчиком используется одна и та же

Максим. Я Вас понял следующим образом:
При установленных входных диапазонах +-10 В обоих модулей Вы подаёте сигнал 0,05 В и получаете разность показаний двух модулей 0,02 V при измерении амплитуд сигналов. Итого, имеем относительную погрешность (между двумя модулями), приведённую к диапазону измерения, равную (0,02/10)*100% = 0,2%
А теперь посмотрите на основную приведённую (к диапазону измерения) относительную погрешность только одного LTR22 (LTR24 в расчёт не берём)
http://www.lcard.ru/products/ltr/ltr22
Эта основная погрешность для диапазона +-10 V равна от 0,15% до 2% в зависимости от частоты сигнала. А ещё есть и дополнительная температурная погрешность, которая по правилам метрологии, не должна быть больше основной в расчёте на 10 град.С изменения температуры. А ещё Вы видите разность погрешностей двух модулей, а не исследуете погрешность одного относительно эталонного средства измерения. А ещё, возможно, полосы частот пропускания двух модулей (и частоты дискретизации) в установленных режимах разные. И Ваш метод оценки амплитуды сигнала нужно смотреть, на сколько он устойчив к шумовой составляющей сигнала, к различиям в частотах дискретизации, отсекается ли постоянная составляющая в методе. Итого, с учётом множества факторов, а также неизвестных (те важные характеристики, которые  Вы не сообщаете), Ваш результат мне кажется вполне нормальным!

Максим, Вы измеряете 0.05V на диапазоне 10V. Кстати, какая частота сигнала?
У LTR22 по документации приведенная погрешность на диапазоне 10V 0.15% (для частот до 5 кГц), то есть 0.15% от диапазона, то есть 0.0015 * 10 V = 0.015 V

А установить диапазон измерений 0.1 или 0.3 V пробовали?