Есть FIFO, есть большой буфер в памяти компьютера. Драйвер читает половинки FIFO и записывает в большой буфер. Так? Т.е. в определенный момент времени актуальные данные находятся только в FIFO?

С L761 не работал, но в E14-140 так же имеется циклический FIFO буффер на 32k. Причем на больших частотах дискретизации может возникнуть потеря данных.

да в фифо...

А до какой команды sync - переменная синхронизации хранит количество принятых отсчетов и когда сбрасывается?