В руководстве пользователя указано наличие 2 входа внешней цифровой синхронизации на плате, значит эти два входа можно опрашивать и синхронизировать выполнение программы. Или я не о том...

Рисунок 1. Режим параллельного вывода звуковых импульсов с  3-х каналов ЦАП.
t1 – может принимать значения 0,075 с, 0,15 с, 0,3 с. (длительность импульса).
t2 = r/170, где r может принимать значения от 300 до 1000 (в основном 500-700).
В этом режиме в процессе сеанса измерения ничего не изменяется, каждый канал работает на своей частоте, импульсы выводятся с ЦАП с фиксированной скважностью.

Рисунок 2. Режим работы с циклической сменой частот выводимых с каналов ЦАП
1к, 2к, 3к – моменты вывода импульсов-посылок на соответствующие каналы ЦАП.
F1, F2, F3 – частоты заполнения трапецеидального импульса
В этом режиме временные интервалы и заданные частоты устанавливаются в начале работы и в процессе не меняются. Изменяется только частоты заполнения импульса по циклическому закону(указано на диаграмме).