Источник импульсов - сигнал газоразрядного датчика пламени, прошедший обработку и выведенный на ножку микроконтроллера. Имеет вид случайно появляющихся импульсов длительностью 25 мкс. Синхросигнала к сожалению нет.
Частоту преобразования АЦП увеличил до 80 кГц. Хотелось 120 кГц, но получается только 100 кГц.

Хорошо, попробуем использовать аналоговый вход.

Спасибо за рекомендации.
Импульсы идут от ножки микроконтроллера, после обработки сигнала газоразрядного датчика. Что касается интервала между импульсами, то его сложно определить.
В идеале желательно периодически подсчитывать количество импульсов появившихся  за время, например, 0,5 сек и выводить число на экран.